home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9603.zip / M9630714.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-02-27  |  3KB  |  40 lines
  1.        Document 0714
  2.  DOCN  M9630714
  3.  TI    Dissecting protein:protein interactions between transcription factors
  4.        with an RNA aptamer.
  5.  DT    9603
  6.  AU    Tian Y; Adya N; Wagner S; Giam CZ; Green MR; Ellington AD; Department of
  7.        Chemistry, Indiana University, Bloomington 47405,; USA.
  8.  SO    RNA. 1995 May;1(3):317-26. Unique Identifier : AIDSLINE MED/96079963
  9.  AB    Nucleic acid aptamers isolated from random sequence pools have generally
  10.        proven useful at inhibiting the interactions of nucleic acid binding
  11.        proteins with their cognate nucleic acids. In order to develop reagents
  12.        that could also be used to study protein:protein interactions, we have
  13.        used in vitro selection to search for RNA aptamers that could interact
  14.        with the transactivating protein Tax from human T-cell leukemia virus.
  15.        Tax does not normally bind to nucleic acids, but instead stimulates
  16.        transcription by interacting with a variety of cellular transcription
  17.        factors, including the cyclic AMP-response element binding protein
  18.        (CREB), NF-kappa B, and the serum response factor (SRF). Starting from a
  19.        pool of greater than 10(13) different RNAs with a core of 120 random
  20.        sequence positions, RNAs were selected for their ability to be
  21.        co-retained on nitrocellulose filters with Tax. After five cycles of
  22.        selection and amplification, a single nucleic acid species remained.
  23.        This aptamer was found to bind Tax with high affinity and specificity,
  24.        and could disrupt complex formation between Tax and NF-kappa B, but not
  25.        with SRF. The differential effects of our aptamer probe on
  26.        protein:protein interactions suggest a model for how the transcription
  27.        factor binding sites on the surface of the Tax protein are organized.
  28.        This model is consistent with data from a variety of other studies.
  29.  DE    Base Sequence  Binding Sites  Binding, Competitive  DNA-Binding Protein,
  30.        Cyclic AMP-Responsive/METABOLISM  DNA-Binding Proteins/METABOLISM  Gene
  31.        Products, tax/ANTAGONISTS & INHIB/*METABOLISM  Molecular Sequence Data
  32.        Nuclear Proteins/METABOLISM  NF-kappa B/METABOLISM  Protein Binding
  33.        RNA/ANTAGONISTS & INHIB/*METABOLISM  Support, Non-U.S. Gov't  Support,
  34.        U.S. Gov't, Non-P.H.S.  Transcription Factors/*METABOLISM  JOURNAL
  35.        ARTICLE
  36.  
  37.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  38.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  39.  
  40.